از بسیاری جهات اکوسیستم پر از میکروب در روده و بافت‌های دیگر فرد ممکن است سلامت انسان را تحت‌تاثیر قرار دهد و تاثیر بالقوه آن در مغز ممکن است تحریک‌آمیز باشد. درحال حاضر، با مطالعه دو گروه بزرگ اروپایی، دریافتند چندین گونه از باکتری‌های روده را در افراد مبتلا به افسردگی از دست رفته است. محققان نمی‌توانند بگویند که آیا این عدم وجود یک علت یا یک اثر از بیماری است اما آن‌ها نشان دادند که بسیاری از باکتری‌های روده مي‌توانند موادی را تشکیل دهند که بر عملکرد سلول‌های عصبی یا شاید خلق وخو تاثیر بگذارند.